pubmed关键词转化解读_pubmed期刊检索入口(2024年12月精选)
2023药物虚拟筛选30篇论文分析 影响因子 在PubMed上以"virtual screening"为关键词搜索并限定2023年,我们发现了多达3700多篇论文。随机抽取了前面的30篇进行分析,发现这些论文的平均影响因子为5.7,其中最高的一篇发表在NC上,其余大部分影响因子在5-7分之间,显示出药物虚拟筛选科研项目的较高水平。 찟쨙拟筛选技术 分子对接是最经典且常用的技术,占比高达97%。其次是分子动力学模拟,占比60%。ADMET预测分析用于评估药物是否能成功转化到细胞效应与体内药效,机器学习/深度学习虽然新颖但尚未完全成熟,而药效团模型则是一个经典且能节省大量计算资源的方法。 𑰟𑨍柳馝妺 商业化合物库仍然是最大的来源,包括ChemDiv、Specs、Maybridge等老牌药用化合物供应商,这些库中的化合物可以随时购买用于生物测试。其次是天然产物/中药库,这些天然产物在几十亿年的进化中形成了容易产生生理效应的结构,是研究的热点。虚拟化合物库虽然量大上限高,但需要有合成渠道。课题组自己收集的化合物也是不少实验室独有的科研秘籍。
PubMed高级检索,精准高效! PubMed的高级检索功能可以让你的文献搜索更加精准和高效!以下是使用高级检索的步骤: 1️⃣ 首先,点击文本框下方的“Advanced”按钮,进入高级检索模式。 2️⃣ 在左侧选择你想要的搜索领域,比如主题词、关键词或标题等;右侧则提供逻辑词选项,包括AND(所有词同时满足)、OR(任意词满足)和NOT(排除特定词)。 3️⃣ 举个例子,如果你想搜索维生素C和癌症的关系,可以这样操作:先输入维生素C,然后点击AND,将其添加到下方的文本框中。接着输入cancer,点击搜索。左侧的领域可以根据你的需求进行选择。 4️⃣ 检索结果会显示出来,比如共找到636种文献。你可以根据左侧的筛选条件进行进一步选择。 ❗️ 注意:如果你无法获取免费文献,可以参照上一篇笔记,复制DOI号,粘贴到谷歌学术上获取PDF文件。
如何高效撰写学术论文? 高效撰写学术论文并非一蹴而就,但以下经验或许能助你一臂之力: 整理实验数据 在开始写作之前,确保你拥有完整的数据。如果数据不完整或思路不清晰,建议暂时不要动笔,以免浪费时间和精力。 蠥𖤽图表 从figure1到figureN,制作所有必要的图表。这一步不仅整理了写作思路,还能帮助你理清文章的逻辑。图表要清晰、美观,字体大小要合适,以便审稿人能够快速捕捉到关键信息。 回顾文献 在开始写作之前,回顾你在课题研究过程中阅读过的文献。通过阅读摘要和全文,整理出相关的实验方法和前沿知识。在NCBI的PubMed上输入关键词,下载所有相关文献的摘要,再筛选出重要的全文进行阅读。阅读过程中要记笔记,记录这篇文章对你的研究有何帮助。 ✍️ 写作策略 从简单的部分开始写作,如图注、材料与方法、结果等。然后撰写引言和讨论部分,这两部分需要在扫文献后,思路清晰时一气呵成。第一版可以忽略语法问题,但重要的是先确定思路。之后可以逐步完善内容,增加细节,并调整语法和语句通顺性。 通过以上步骤,希望能帮助你高效撰写学术论文,祝你写作顺利!
高效阅读英文文献的三大关键技巧 在阅读英文文献时,明确目的和做好总结是两个至关重要的技巧。以下是一些实用的建议: 明确阅读目的斥 ,要明确你阅读文献的目的。是为了学习某个理论?了解背景信息?还是为了汇报工作?又或者是为了模仿别人的实验设计?你需要清晰地知道自己的需求,并将这些需求转化为具体的检索关键词。可以将这些关键词写下来,贴在显眼的地方,这样在阅读时会有一种任务感,帮助你更有方向感。 做好总结 总结是阅读过程中的一个重要环节。你可以将文献的标题、摘要翻译以及一句话总结(例如:某人在某领域进行了某实验,验证了某猜想,支持了某观点)记录下来。这样可以帮助你更好地理解和记忆文献内容。个人建议是边看边总结,不要拖延,及时记录下自己的思考和收获。 逐步提升阅读量 刚开始阅读英文文献时,可能会感到有些困难和排斥。不要担心,这是正常的。你可以从简单的文献开始,逐步提升阅读量。随着阅读量的增加,你会逐渐熟悉文献的阅读方式,形成自己的阅读习惯。 关于翻译工具的选择 虽然不能完全依赖机器翻译,但对于新手来说,直接阅读原文是不现实的。因此,开始时可以追求数量,多读多看,用什么方法都可。随着阅读量的增加,你会逐渐熟悉英文文献的阅读方式,形成自己的阅读习惯。 我的阅读模式 我的阅读模式是流水线式的: 确定搜索方向和目的,写在便利贴上。 直接搜索标题,一次搜索两三个关键词。 将PubMed检索页面设置为一次显示100条结果,并查看摘要。 先简单浏览标题,符合要求的就点进去看看摘要,了解文章的主要内容。 将有用的文献标题按引用格式复制到Word里,再看看页面的摘要,总结成一行字,写在Word里。 完成这些工作后,再去逐一找文献全文。 将找到的全文导入Zotero。 按日期、主题等分类。 逐一阅读,也可以先读最感兴趣的。 通过这些步骤,你可以更高效地阅读和理解英文文献。希望这些技巧对你有所帮助!
Meta分析15步,轻松搞定! Meta分析,也叫荟萃分析或元分析,是一种通过合并多个独立研究结果来得出更可靠结论的方法。下面是一些进行Meta分析的步骤,希望能帮到你。 选题与注册 首先,你需要选择一个合适的主题进行Meta分析。可以在PROSPERO网站上注册你的研究项目。 制定检索词和检索式 接下来,确定你要使用的关键词和搜索策略。这将帮助你找到相关的研究文献。 制定纳入标准和排除标准 明确哪些研究应该纳入,哪些应该排除。这将确保你的Meta分析结果更加准确。 数据库检索 利用知网、万方、维普、CBM、Pubmed、Embase、Cochrane等数据库进行检索。别忘了在中国和美国临床注册中心(Chictr & ClinicalTrials)上查找相关信息。 纳入文献管理 使用Endnote、NoteExpress等工具来管理你纳入的文献。同时,进行质量评价,确保研究的质量。 数据提取 制作数据提取表,进行数据转换和缺失数据处理。这一步非常关键,因为数据的质量直接影响你的分析结果。 效应量 选择合适的效应量,如OR、RR、RD、HR、WMD和SMD。这将帮助你量化研究结果。 森林图制作 𓊤蒥vMan或Stata等软件制作森林图,直观地展示研究结果。 漏斗图制作 制作漏斗图,如普通漏斗图、Begg漏斗图、Egger漏斗图、Harbord漏斗图和轮廓增强漏斗图,来检测发表偏倚。 发表偏倚检测 通过漏斗图、Egger检验、剪补法、失安全系数法和累积森林图法来检测发表偏倚。 异质性检验和处理 슨🛨ጤ析、Labbe图、Galbraith图、敏感性分析和Meta回归来处理异质性。 敏感性分析 ꊤ訽즍⦨ᥞ法、剪补法、单项研究对合并量的影响和失安全系数法来进行敏感性分析。 证据质量推荐 根据GRADE分级来推荐证据的质量。 PRISMA声明清单 遵循PRISMA声明清单,确保你的Meta分析符合规范。 其它类型Meta分析 进行危险因素或疾病影响因素的Meta分析、单臂研究的Meta分析(包括效应指标为率、比例、发病密度、比值和均数的Meta分析)、生存资料的Meta分析、诊断试验的Meta分析、遗传基因多态性(SNP)的Meta分析、相关系数r的Meta分析(包括Pearson系数r值和Spearson系数r值的Meta分析)、效应量直接为OR、RR、RD、HR的Meta分析和累积Meta分析及其趋势检验。 希望这些步骤能帮助你顺利开展Meta分析!
相见恨晚!Kimi你真的太棒了튋imi,你真的太厉害了!后悔现在才知道你有多强大! 深入主题研究:利用学术数据库如Web of Science和PubMed进行文献回顾,找出近五年来的研究趋势,并提出具有前瞻性和实用性的研究问题。 精炼摘要:用简洁明了的语言撰写摘要,避免冗余。摘要应包括研究目的、方法、结果和结论,但不陷入过多细节。 精选关键词:挑选能反映研究主题和范围的关键词,以提高论文的可见性和被引用率。参考热门搜索词汇和高频词汇,避免使用通用或不相关的词汇。 构建引言:清晰地阐述研究背景,建立理论框架,明确研究目的和意义。 正文结构设计:正文部分应包括研究背景、理论依据、研究方法、结果分析和讨论。确保结构清晰、逻辑严密。 结论撰写策略:总结研究的主要成果,评价研究的意义,并提出未来的研究方向。 致谢编写:真诚地表达对帮助者的感激之情,保持简洁明了。 附录的有效利用:提供额外的资料,如数据表、研究工具等,避免与正文内容重复。 参考文献整理:确保所引用的文献与研究主题直接相关,并按照指定的格式进行排列。
如何用单细胞技术发表高分文章? 单细胞分析近年来成为科研热点,其研究进展迅速,吸引了大量科研人员。以“Single-Cell RNA Sequencing”为关键词在PubMed上搜索,截至2023年已发表超过20693篇研究论文。单细胞测序技术在肿瘤、免疫、传染病及细胞进程研究等各个生命科学领域中迅速发展,其精准的分析能力和广泛的应用潜力吸引了科研和临床研究人员的关注。 单细胞测序的流程包括:单细胞捕获、单细胞裂解、遗传物质的提取扩增、文库构建、测序与数据处理。虽然相对于传统测序技术更为复杂,但单细胞测序已经是一项成熟的技术。 分析单细胞测序数据不仅是科研人员的基本技能,也成为发表高分文章的必备要素之一。Cell、Nature、Science等期刊上不同研究方向的单细胞测序文章层出不穷。 掌握单细胞测序技术,不仅能帮助您更好地理解生命科学领域的研究,还能为您的科研工作带来更多可能性。
科研新手必看:如何精读文献(超详细教程) 刚开始做课题时,导师通常会让你写一篇综述,目的是了解目前研究进展和值得研究的方向。这是一篇非常详细的精读文献教程,大家耐心阅读哦! ✅ 第一步:筛选需要精读的文献 使用工具:UPDF + Pubmed + Endnote 1️⃣ 获取关键词 很多同学在搜索文献时遇到困难,很可能是搜索策略有问题。可以先在Google中搜索主题词,例如衰老相关的词是“senescence”,然后在UPDF的聊天功能中输入相关主题词进行搜索。 2️⃣ 在Pubmed中输入关键词,根据需求更改逻辑词为“and”或“or”。 3️⃣ 面对大量检索结果,可以筛选最新且影响因子最高的文章,点击引用并导入到Endnote(具体使用方法见之前的笔记)。 4️⃣ 在Endnote中通过标题筛选出与课题最相关的文章,进行摘要阅读,确定相关后点击下载。 ✅ 精读环节: 使用工具:UPDF 1️⃣ 将文章导入UPDF软件中,用UPDF来做笔记。精读文章是为了服务于你的课题,看完后要搞清楚整篇文章的逻辑。 2️⃣ 使用UPDF的AI功能先看整篇文章的主要内容,点击PDF总结,UPDF会帮你总结文章的主要内容(如图4所示)。 3️⃣ 接着看Introduction部分,如果遇到知识盲区,可以通过UPDF的提问功能快速搜索到自己不懂的知识点(如图5所示)。 4️⃣ 重点阅读图表和结果部分(如图6所示)。 5️⃣ 在Discussion部分寻找课题的创新点和未来研究方向。 6️⃣ 最后看Materials & Methods部分(具体方法见图7)。 希望这篇教程能帮助大家更好地进行科研文献阅读!
5个必备外文文献检索网站,你知道几个? 文献检索是每个研究生必备的技能,但导师通常不会具体指导如何操作。以下是一些常用的外文文献检索网站,帮助你快速找到所需资料: Google学术:使用英文关键词搜索,可以获得更全面和准确的结果。 Web of Science:涵盖多个学科领域,是科研人员常用的文献检索工具。 中国知网:虽然主要服务于国内学术研究,但也能找到一些外文文献。 Pubmed:专注于生物医学领域,提供丰富的学术资源。 百度学术:使用英文关键词搜索,可以获得更全面和准确的结果。 在使用这些网站时,建议尽量使用英文关键词进行搜索,以获得更广泛和准确的结果。通过这些网站,你可以轻松找到各种领域的学术文献,助力你的研究工作。
Pubmed引物设计,轻松搞定! 引物设计的基本原则: 特异性:引物应设计在核酸序列的保守区内,并具有特异性。 二级结构:避免在能形成二级结构的区域设计引物。 产物结构:产物不能形成二级结构。 长度:引物长度一般在15~30碱基之间,G+C含量在40%~60%之间。 碱基分布:碱基要随机分布。 互补性:引物自身不能有连续4个碱基的互补,引物之间也不能有连续4个碱基的互补。 修饰:引物5′端可以修饰,3′端不可修饰。 密码子:引物3′端要避开密码子的第3位。 Tm值:引物所对应模板位置序列的Tm值在72℃左右可使复性条件最佳。 值:3′端值较低(绝对值不超过9),而5′端和中间值相对较高的引物为佳。 引物二聚体:引物二聚体及发夹结构的能值过高(超过4.5kcal/mol)易导致产生引物二聚体带,降低引物有效浓度。 酶切位点:引物的3′端要与模板严格配对,而5′端碱基没有严格的限制,只要与模板DNA结合的部分足够长,其5′端碱基可不与模板DNA配对而呈游离状态,这样可以在引物的5′末端加上酶切位点。 騮᧚具体流程: 打开Pubmed,输入关键词,点击搜索。 在搜索结果中选择一个点击进入,获取相关信息。 点击“Pick Primers”按钮。 根据引物设计原则填写相关信息,如产物长度、引物长度、Tm值、FASTA sequence等,然后点击“Get Primers”。 系统会生成多条引物序列,根据需要及引物设计原则选择合适的引物序列。 应用BLAST检验引物序列。打开Pubmed,点击首页下方的BLAST,将选择的引物序列输入,点击blast,搜索结果中有我们刚刚查询的NM-021283.2,说明此序列无误。 通过以上步骤,你就可以成功设计出适合你的qPCR引物啦!
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